混合型RTA指Ⅰ、iⅡ型混合存在。有人认为此型为Ⅱ型肾小管酸中毒的一个亚型。尿中排出大量HCO₃^-，l尿可滴定酸及铵排出减少，l即使在血浆HCO₃^-浓度正常时，l尿HCO₃^-排出也＞15％的滤过量。此型的临床症状一般较重。

而所谓的Ⅲ型肾小管酸中毒是指Ⅰ型RTA伴有HCO₃^-丢失，l与混合型RTA相似，l有人认为是Ⅰ型的一个亚型。病人有着Ⅰ、iⅡ两型的临床表现。当血浆HCO₃^-正常时，l尿HCO₃^-排泄分数在5％～10％之间，l酸中毒时，l排出量则更大。

治疗与Ⅰ、iⅡ型相同。